Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shc4Q6S5L9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc4Q6S5L9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms