Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54bQ6PFE3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms