Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms