Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mfsd13aQ6PDE8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mfsd13aQ6PDE8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms