Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gapvd1Q6PAR5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gapvd1Q6PAR5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms