Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC061212Q6P8K3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms