Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc148Q6P5U8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc148Q6P5U8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms