Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam222bQ6P539 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms