Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B2

Ubald1, UBA-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubald1Q6P3B2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms