Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppp4r3aQ6P2K6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp4r3aQ6P2K6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp4r3aQ6P2K6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp4r3aQ6P2K6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp4r3aQ6P2K6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp4r3aQ6P2K6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp4r3aQ6P2K6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms