Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pprc1Q6NZN1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pprc1Q6NZN1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pprc1Q6NZN1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pprc1Q6NZN1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pprc1Q6NZN1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pprc1Q6NZN1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pprc1Q6NZN1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pprc1Q6NZN1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pprc1Q6NZN1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pprc1Q6NZN1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pprc1Q6NZN1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pprc1Q6NZN1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms