Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Soga3Q6NZL0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Soga3Q6NZL0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Soga3Q6NZL0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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