Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpbp1Q6NXH3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms