Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23aQ6NVH0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23aQ6NVH0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms