Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc66Q6NS45 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms