Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ParpbpQ6IRT3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ParpbpQ6IRT3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParpbpQ6IRT3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms