Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt39Q6IFX4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt39Q6IFX4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms