Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arhgap20Q6IFT4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms