Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9bQ6EBV9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg9bQ6EBV9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms