Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cep170Q6A065 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cep170Q6A065 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cep170Q6A065 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cep170Q6A065 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cep170Q6A065 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cep170Q6A065 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cep170Q6A065 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cep170Q6A065 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cep170Q6A065 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cep170Q6A065 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cep170Q6A065 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep170Q6A065 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cep170Q6A065 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms