Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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