Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms