Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgefl1Q68EF8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms