Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BC080695Q66JY9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC080695Q66JY9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms