Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnna3Q65CL1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna3Q65CL1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms