Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms