Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clcn1Q64347 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms