Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PatjQ63ZW7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PatjQ63ZW7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms