Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ift52Q62559 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift52Q62559 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift52Q62559 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift52Q62559 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift52Q62559 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift52Q62559 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift52Q62559 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift52Q62559 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift52Q62559 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms