Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp1Q62442 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp1Q62442 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms