Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl12Q62401 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms