Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt6hQ62383 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt6hQ62383 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms