Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf6Q62311 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms