Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SypQ62277 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SypQ62277 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SypQ62277 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SypQ62277 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SypQ62277 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SypQ62277 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SypQ62277 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SypQ62277 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SypQ62277 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SypQ62277 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SypQ62277 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SypQ62277 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SypQ62277 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SypQ62277 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SypQ62277 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SypQ62277 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SypQ62277 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SypQ62277 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SypQ62277 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SypQ62277 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SypQ62277 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SypQ62277 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SypQ62277 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SypQ62277 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SypQ62277 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SypQ62277 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SypQ62277 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SypQ62277 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SypQ62277 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SypQ62277 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SypQ62277 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SypQ62277 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SypQ62277 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SypQ62277 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SypQ62277 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SypQ62277 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SypQ62277 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SypQ62277 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SypQ62277 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SypQ62277 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SypQ62277 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms