Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tgfb1i1Q62219 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb1i1Q62219 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms