Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SspnQ62147 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SspnQ62147 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SspnQ62147 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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