Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd1Q62101 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms