Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifi47Q61635 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifi47Q61635 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms