Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd55bQ61476 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd55bQ61476 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cd55bQ61476 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd55bQ61476 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd55bQ61476 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd55bQ61476 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd55bQ61476 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd55bQ61476 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd55bQ61476 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd55bQ61476 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms