Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccne1Q61457 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms