Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irf9Q61179 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf9Q61179 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf9Q61179 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms