Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf3Q60980 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms