Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JrkQ60976 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JrkQ60976 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JrkQ60976 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrkQ60976 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrkQ60976 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms