Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna1Q60960 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms