Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep250Q60952 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep250Q60952 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms