Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbpQ60925 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms