Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod1Q60867 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms