Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf8Q60846 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf8Q60846 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms