Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn2dQ60773 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms