Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Csnk2a1Q60737 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms